仓库主要存放各州府独立计算的生产物资，内容包括原料、加工品、活动主题材料和部分任务奖励，不是全部城市共用壹个总库存。进入对应州府后，可在营造—居住中找到仓库建筑；查看资源时要先确认当前所在城市，由于应天府、苏州府、杭州府、松江府、徽州府、扬州府等地的仓库存量分别统计，跨城运用通常需要通过码头运输。仓库本身的基础存储量为250格，更新后可增加容量，适合优先放置经常用于生产链和任务兑换的资源。

前期仓库里最常见的是饭、肉、菜、原木、木板、纸张、棉花、布匹、成衣、黏土和瓷器等基础物资。它们通常按原料—半成品—成品排列，例如原木可加工成木板，木板再用于造纸；棉花可加工成布匹，布匹继续生产成衣；黏土则进入瓷窑制作瓷器。饭、肉、菜主要服务居民和生产消耗，原木、木板、纸张常用于建筑更新和生产，布匹、成衣、瓷器则更多出现在任务、商业和城市建设需求中。新人不必平均囤满全部格子，优先保留饭、菜、原木、木板和当前主线标准的成品即可。

中后期仓库还会出现各城市的特色资源和限制性材料，例如应天府常用棉花、布匹、云锦，苏州府涉及蚕丝、丝绸、刺绣，杭州府会用到竹子、桑叶、折扇和团扇材料，松江府有布鞋、标布、黑核棉及盐，徽州府集中笔、墨、纸、砚和合石，扬州府则包含玉石、玉器、粟米、香粉、油墨、年历和经书等。部分资源并非当前城市稳定产出，最典型的是应天府制作云锦需要丝绸、杭州府制作木炭需要原木，这类材料应先在产地生产，再从码头运输，不能只盯着本城仓库反复等待。

需要区分的是，材料仓库和建筑仓库不是同壹个存储空间：材料仓库保存生产、任务和活动主题资源，建筑仓库则保存暂时收起的生产建筑、商业建筑、娱乐建筑或装饰物，查看入口通常在改布局或营造界面。前期玩家应把常用生产线附近的仓库容量留给饭、木材和任务材料；解开多座城市后，优先更新经常承担活动主题的对应仓库，并通过三级码头增加运输效率。应天餐馆、桃花村等内容主要消耗应天仓库，杭州商栈对应杭州仓库，松江倭寇入侵、徽商跑商和扬州漕运则分别运用松江、徽州和扬州仓库，提前整理对应城市的库存，能避免活动主题开始后因容量不足或材料放错城市而中断。